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圓桌討論的想法
在過去五年中，生物學(xué)家已經(jīng)獲得了以低成本生成更大數(shù)據(jù)集的能力，因此開始更頻繁地與數(shù)學(xué)家、統(tǒng)計(jì)學(xué)家和生物信息學(xué)家合作，以確定存儲(chǔ)、分析和解釋這些數(shù)據(jù)的最佳方法。作為一名訓(xùn)練有素的生物數(shù)學(xué)家，我已經(jīng)學(xué)會(huì)了如何在自己的研究中整合計(jì)算和實(shí)驗(yàn)技術(shù)，因此與實(shí)驗(yàn)家和計(jì)算科學(xué)家合作對(duì)我來說很自然，而且我經(jīng)常發(fā)現(xiàn)自己將我的統(tǒng)計(jì)專業(yè)知識(shí)借給了我的同事。然而，我經(jīng)常想知道純實(shí)驗(yàn)主義者與計(jì)算科學(xué)家接觸和合作是多么容易，反之亦然。實(shí)驗(yàn)者經(jīng)常以相對(duì)簡單的任務(wù)接近生物信息學(xué)家。作為計(jì)算科學(xué)家，我們?nèi)绾尾拍?br /> 第一步可能是嘗試將實(shí)驗(yàn)科學(xué)家和計(jì)算科學(xué)家放在可以交流、學(xué)習(xí)和形成合作的同一空間中。最近的一個(gè)例子發(fā)生在愛荷華州立大學(xué)，在那里我參加了一個(gè)題為“通過計(jì)算表型發(fā)現(xiàn)新候選基因”的小型研討會(huì)。

ISU 總統(tǒng)跨學(xué)科研究種子 (PIRS) 授予了遺傳學(xué)、發(fā)育和細(xì)胞生物學(xué)系的 Diane Bassham 博士、Carolyn Lawrence-Dill 博士和 Drena Dobbs 博士以及 Dr. . 來自動(dòng)物科學(xué)系的 Matthew Ellinwood。該研討會(huì)被宣傳為一個(gè)跨學(xué)科活動(dòng)，鼓勵(lì)實(shí)驗(yàn)和計(jì)算科學(xué)家參加，其想法是在他們之間開始新的對(duì)話并建立新的合作。甚至研討會(huì)的圖像也鼓勵(lì)跨學(xué)科，比較小鼠神經(jīng)元和植物毛狀體之間結(jié)構(gòu)的相似性。
我們認(rèn)為“簡單”或“容易”的概念，例如何時(shí)使用非參數(shù)檢驗(yàn)或 p 值的含義，可能并不容易被實(shí)驗(yàn)者理解
我發(fā)現(xiàn)研討會(huì)上長達(dá)兩個(gè)小時(shí)的親和小組討論特別有意義。對(duì)于這些討論，我們被鼓勵(lì)在會(huì)議期間提出主題，隨后組織者選擇了四個(gè)主題進(jìn)行圓桌討論。其中兩個(gè)主題側(cè)重于改進(jìn)生物信息學(xué)教育和增加跨學(xué)科交流。

討論跨學(xué)科合作的與會(huì)者提出了挑戰(zhàn)，既要開始此類合作，又要弄清楚如何更好地促進(jìn)它們。例如，有時(shí)由于“語言障礙”，跨學(xué)科合作永遠(yuǎn)不會(huì)起步。任何一方的人都用對(duì)方無法理解的過于專業(yè)的術(shù)語說話。作為計(jì)算生物學(xué)家，重要的是我們要理解我們認(rèn)為“簡單”或“容易”的概念，例如何時(shí)使用非參數(shù)檢驗(yàn)或 p 值的含義，可能并不容易被實(shí)驗(yàn)者理解. 另一方面，實(shí)驗(yàn)者應(yīng)該記住，許多數(shù)學(xué)家和計(jì)算機(jī)科學(xué)家可能甚至沒有上過普通的本科生物課。
作為一個(gè)團(tuán)隊(duì)，我們還一致認(rèn)為，要使合作取得成功，重要的是要花費(fèi)額外的時(shí)間和精力來確保每個(gè)人都理解基本概念，然后再繼續(xù)解決復(fù)雜的問題。除此之外，雙方的人都需要在缺乏知識(shí)的情況下保持安全，并且不要害怕提出對(duì)其他人來說似乎很明顯的“愚蠢問題”。

最后，我們一致認(rèn)為協(xié)作應(yīng)該是自然而直觀的，而不是強(qiáng)迫的。這個(gè)親和力小組提出的建議得到了許多關(guān)于成功合作科學(xué)的工作的支持，例如 PLOS 計(jì)算生物學(xué)的“十個(gè)簡單規(guī)則”系列中的條目（發(fā)表于2007 年、2015年和2017 年），以及來自 2017 年的一項(xiàng)研究合作工作研究所的“理解合作心理學(xué)”都總結(jié)了有效合作的趨勢(shì)。
我個(gè)人同意這些關(guān)于促進(jìn)跨學(xué)科合作的建議，但我也認(rèn)為通過教育年輕學(xué)生如何成為跨學(xué)科科學(xué)家，可以更早地解決合作中的困難。
我很幸運(yùn)有機(jī)會(huì)在我的本科院校里士滿大學(xué)學(xué)習(xí)跨學(xué)科科學(xué)，作為其綜合包容性科學(xué)計(jì)劃的第一批成員。該計(jì)劃的教師后來發(fā)表了他們的發(fā)現(xiàn)，即與未參加該課程的學(xué)生相比，該跨學(xué)科計(jì)劃的學(xué)生更有可能參加額外的數(shù)學(xué)、物理和計(jì)算機(jī)科學(xué)課程。其他教育機(jī)構(gòu)，如北卡羅來納州立大學(xué)、斯坦福大學(xué)、三一學(xué)院、卡內(nèi)基梅隆大學(xué)等，也在追隨這一趨勢(shì)，并在本科和研究生階段提供自己的綜合科學(xué)課程。

在愛荷華州的親和小組討論中，我們還得出結(jié)論，與其嘗試設(shè)計(jì)一個(gè)全新的專業(yè)或課程，不如提供跨學(xué)科科學(xué)的小型模塊化課程對(duì)于已經(jīng)被大量課程淹沒的本科生和研究生更有效——加載。以我自己的經(jīng)驗(yàn)，我作為本科生修讀的綜合包容性科學(xué)輔修課程占用了其他專業(yè)課程太多的時(shí)間，學(xué)生們覺得他們必須在專注于他們的專業(yè)和參與該項(xiàng)目之間做出選擇。
在研討會(huì)上，我們的參與者還設(shè)想這些模塊化課程應(yīng)該由生物學(xué)家和統(tǒng)計(jì)學(xué)家共同教授，涵蓋諸如生物統(tǒng)計(jì)學(xué)、非參數(shù)和非線性統(tǒng)計(jì)學(xué)、信息論、機(jī)器學(xué)習(xí)、基礎(chǔ)數(shù)學(xué)建模和基礎(chǔ)編程。這些模塊也應(yīng)該面向一年級(jí)和二年級(jí)學(xué)生，而不僅僅是已經(jīng)宣布專業(yè)的學(xué)生，因?yàn)槲覀冋J(rèn)為這些跨學(xué)科主題的教育應(yīng)該在職業(yè)生涯的早期開始。最后，我們認(rèn)為，雖然可以提供有關(guān)這些主題的課程的資源，但我們發(fā)現(xiàn)它們對(duì)學(xué)生來說是無法獲得的（即廣告宣傳不佳或在付費(fèi)墻后面）或課程本身缺乏（即課程假定一定程度的背景知識(shí)，并非所有學(xué)生都有）。

總之，我認(rèn)為更多的研討會(huì)和會(huì)議應(yīng)該包含專注于跨學(xué)科教育和合作的討論組，以便我們能夠繼續(xù)獲得反饋、改進(jìn)現(xiàn)有項(xiàng)目并開發(fā)新的解決方案。
根據(jù)我的個(gè)人經(jīng)驗(yàn)，以及我在 2019 年 PIRS 小型研討會(huì)上從其他人那里聽到的信息，我強(qiáng)烈鼓勵(lì)對(duì)跨學(xué)科主題感興趣的年輕科學(xué)家現(xiàn)在就開始學(xué)習(xí)。參加暑期編程課程或參加專業(yè)以外的課程只是因?yàn)樗犉饋砗苡腥ぃ皇且驗(yàn)樗潜匦璧?。我也鼓?lì)那些跨學(xué)科合作的科學(xué)家開始更多的對(duì)話。我們應(yīng)該向我們的合作者介紹我們更廣泛的專業(yè)網(wǎng)絡(luò)，并幫助我們的科學(xué)家同行找到新的合作。
通過更好的教育和網(wǎng)絡(luò)，我們可以改善所有科學(xué)家的資源，以便隨著技術(shù)的不斷發(fā)展、數(shù)據(jù)集的不斷擴(kuò)大以及生物學(xué)問題變得越來越復(fù)雜，我們可以提供迫切需要的跨學(xué)科解決方案。